沐诩

2019-12-29

青岛能源所提出微生物组相似度新算法DMS

自然界中,微生物组无所不在,其结构深刻体现着生态系统的健康状态,因此微生物组结构比对是菌群检测服务于精准健康、精准护理与精准营养的核心环节之一。中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心提出了Dynamic Meta-Storms算法,能够更精确地计算菌群相似度。该研究在线发表于Bioinformatics。DMS充分利用菌群中已知物种的生物分类和进化关系,对未知物种的进化位置进行理性推测(图1),从而能够全面、精确地计算元基因组之间物种水平的相似度(图2a)。